有機肥的使用方法一般有三種：經過發酵加工后施入農田；秸稈直接還田；與化學肥料混合后施入農田。  

 
    一、發酵加工技術 。主要包括高溫發酵技術和嫌氧發酵技術。高溫發酵堆制技術是將各種有機肥料堆成一定大小的堆，約經過一個月的發酵，即可成為有機肥料，這種肥料稱為堆肥。其堆制過程一般分為三個階段：發熱階段、高溫階段和降溫階段。嫌氧發酵是利用嫌氧微生物分解有機物料，從而加工制造成有機肥料。完全嫌氧一般視為沼氣發酵，不完全嫌氧發酵就是有機肥料的漚制技術，簡稱為漚肥。  

 
    二、秸稈還田。農作物收獲后，把秸稈直接翻入土中，讓其自然腐爛，稱為秸稈還田。秸稈還田是增加土壤有機物質的簡便途徑，能夠改善土壤的物理性質，培肥改土，提高土壤生物的活性，減少養分流失。   

    三、有機無機復混肥料加工技術。有機肥料由于其體積大，養分含量低，肥效比較慢，很難大面積推廣應用。無機化學肥料養分含量高，肥效快，但養分流失嚴重，長期施用對土壤和環境會造成不利影響。將兩種肥料結合起來，生產有機、無機復混肥料，則可以克服二者的短處，發揮他們的長處，是肥料發展的新方向。

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